More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0139 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  215  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  70.75 
 
 		 106 aa  168  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  74.76 
 
 		 104 aa  167  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  68.57 
 
 		 106 aa  157  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  67.62 
 
 		 119 aa  156  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  67.62 
 
 		 106 aa  156  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  68.27 
 
 		 108 aa  156  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  66.02 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  63.81 
 
 		 107 aa  153  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  63.81 
 
 		 107 aa  153  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  60.95 
 
 		 111 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  63.11 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  62.26 
 
 		 107 aa  150  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  67.65 
 
 		 108 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  66.67 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  67.33 
 
 		 108 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  63.11 
 
 		 110 aa  150  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  61.17 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  64.81 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  67.65 
 
 		 109 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  63.11 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  67.33 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  63.11 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  63.11 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  63.11 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  66.67 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  64.71 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  65.69 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  65.09 
 
 		 106 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  64.36 
 
 		 108 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  66.67 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  66.34 
 
 		 108 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  62.86 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  64.71 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  65.35 
 
 		 108 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  66.34 
 
 		 108 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  65.35 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  65.35 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  63.81 
 
 		 108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  64.36 
 
 		 108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  64.36 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  61.17 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  61.76 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  64.71 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  65.69 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  65.69 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  64.71 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  63.73 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  62.38 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  62.38 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  62.38 
 
 		 116 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  62.14 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  63.73 
 
 		 108 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  143  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  61.17 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  62.75 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  63.73 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  57.69 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  59.63 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  61.17 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  64.36 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  61.76 
 
 		 108 aa  140  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  58.1 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  60.19 
 
 		 110 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  140  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>