More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3433 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  74.76 
 
 		 106 aa  167  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  68.93 
 
 		 106 aa  157  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  70.3 
 
 		 108 aa  157  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  64.42 
 
 		 109 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  65.98 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  62.75 
 
 		 106 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  64.08 
 
 		 106 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  64.42 
 
 		 109 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  65.35 
 
 		 108 aa  150  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  63.73 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  63.46 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  62.5 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  62.75 
 
 		 106 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  62.5 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  64.71 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  62.5 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  65.69 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  63.73 
 
 		 106 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  62.75 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  60.58 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  60.58 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  62.75 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  62.75 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  63.37 
 
 		 106 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  64.71 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  62.38 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  62.38 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  62.38 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  62.38 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  59.62 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  60.4 
 
 		 133 aa  143  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  65 
 
 		 108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  60.58 
 
 		 108 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  62 
 
 		 110 aa  143  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  63.73 
 
 		 108 aa  143  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  62.38 
 
 		 119 aa  143  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  59.41 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  60.58 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  53.85 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  62.38 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  59.22 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  59.22 
 
 		 106 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  60.4 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  60.4 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  58.65 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  61.39 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  61.76 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  58.65 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  59.62 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  57.69 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  57.69 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  57.69 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  60.78 
 
 		 109 aa  140  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  56.73 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  60.78 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  58.82 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  58.42 
 
 		 110 aa  140  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  60.78 
 
 		 108 aa  140  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  60.78 
 
 		 108 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  62 
 
 		 107 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  60.78 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>