More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0728 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  209  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  94.23 
 
 		 104 aa  203  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  94.23 
 
 		 104 aa  203  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  64.42 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  58.65 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  55.77 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  57.84 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  58.65 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  56.86 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  59 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  60.58 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  59.62 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  58 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  57 
 
 		 109 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  56.44 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  52.88 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  57 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  56 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  59.8 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  54 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.38 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  53.33 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  55.88 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  53.61 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  55 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  53.47 
 
 		 104 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  56.31 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  52.48 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  50.49 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  54 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  56.73 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  54.81 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  47.62 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  49.51 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  57.28 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  52.38 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  52.04 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  49.51 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.5 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  55.45 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  57.73 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  56.73 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  52 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  51.49 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  48.08 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  49.51 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  59.04 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  50.51 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  52.94 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  54 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  52 
 
 		 106 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  57.73 
 
 		 109 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  57.73 
 
 		 109 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  57.73 
 
 		 109 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  48.51 
 
 		 238 aa  113  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  57.14 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  53 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  52.48 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  51.46 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  52.58 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  50.96 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  46.08 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  55.45 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  53 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  54 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  52.88 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  52 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  52.48 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  51.49 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  52 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>