More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1896 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  64.71 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  58.42 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  52.58 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  54.08 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  51.55 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  52.58 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  50.52 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  51.55 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  56.25 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  54.64 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  54.64 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  47.42 
 
 		 105 aa  113  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  52.58 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  50.54 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  50.55 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  46.88 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  48.45 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  48.45 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  48.45 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  50.52 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  49.48 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  45.45 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  52.22 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  45.74 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  47.42 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  47.96 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.88 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  48.39 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  47.37 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  50.53 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  45.36 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  48.42 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  48.45 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  52.22 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  47.42 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  52.08 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  46.53 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  51.58 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  45.36 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  48.51 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  48.45 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  51.11 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  43.88 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  42.27 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  49.5 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  46.88 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  49.46 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  42.27 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  48.39 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  53.49 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  42.27 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  45.19 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  44.33 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.26 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  47.87 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  44.9 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  45.36 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  44.33 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  52.22 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  47.42 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  46.39 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  46.39 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  52.22 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  48.42 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  47.42 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  46.81 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  41.75 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  45.26 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  49.48 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45.36 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>