More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0888 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  100 
 
 
141 aa  289  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  78.1 
 
 
141 aa  220  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  57.97 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  46.85 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  44.12 
 
 
150 aa  127  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  60.23 
 
 
115 aa  123  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  44.53 
 
 
150 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  60.44 
 
 
108 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  58.24 
 
 
107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  61.54 
 
 
109 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  61.54 
 
 
109 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  61.54 
 
 
109 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  59.34 
 
 
106 aa  120  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  44.03 
 
 
149 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  54.95 
 
 
107 aa  120  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  62.07 
 
 
109 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.95 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  59.34 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  54.95 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  54.95 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  54.95 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  60.23 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  54.95 
 
 
107 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  54.95 
 
 
124 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  60.44 
 
 
108 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  60.44 
 
 
106 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  56.04 
 
 
110 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  57.14 
 
 
109 aa  118  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  61.54 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  59.34 
 
 
108 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  54.95 
 
 
125 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  54.55 
 
 
109 aa  116  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  58.51 
 
 
112 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  58.51 
 
 
112 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  44.03 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  54.55 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.65 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.75 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.65 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  56.04 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  44.03 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  44.96 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  44.03 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  59.34 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  51.65 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  57.65 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  54.95 
 
 
108 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  114  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50 
 
 
120 aa  114  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  54.95 
 
 
108 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  54.95 
 
 
108 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  54.95 
 
 
108 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  44.03 
 
 
144 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  58.33 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  44.78 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  39.26 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  56.18 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  58.33 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  60 
 
 
106 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  54.95 
 
 
108 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  58.24 
 
 
106 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  56.04 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  59.34 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  55.32 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  52.22 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  57.14 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  56.82 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  54.26 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  52.75 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  52.75 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  52.75 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  55.32 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  52.75 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  62.2 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  55.32 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  52.04 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  55.32 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  55.32 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  55.32 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  59.04 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  52.13 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  55.32 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  55.32 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  49.45 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  55.32 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>