More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1867 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  75.24 
 
 		 105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  73.33 
 
 		 104 aa  169  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  72.38 
 
 		 104 aa  168  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  70.48 
 
 		 105 aa  166  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  71.43 
 
 		 104 aa  166  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  71.43 
 
 		 104 aa  166  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  71.43 
 
 		 104 aa  166  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  71.43 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  69.52 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  59.26 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  54.21 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  57.28 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  127  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  60.2 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.83 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  56.44 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  54.21 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  53.7 
 
 		 109 aa  124  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  53.27 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  56.7 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  54.46 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  54.46 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  52.88 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  52.78 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  53.4 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  53.47 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  51.43 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  60.71 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  59.52 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  60.71 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  52.43 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  55.1 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  51.46 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  59.52 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  59.52 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  59.52 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  51.4 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  57.14 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  55.45 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  55.1 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  49.51 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  58.33 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  52.48 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  51.92 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  52.43 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  50.49 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  51.02 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  50.47 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  52.43 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  48.04 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  50.49 
 
 		 223 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  53.54 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  49.04 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  49.02 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  50.5 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  46.08 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.47 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  59.04 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  47.12 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  50.49 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  52.43 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  51.46 
 
 		 110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  51.46 
 
 		 110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  48.48 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  48.57 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  52.63 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  51.49 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  53.19 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  48.54 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  49.49 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  50.96 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  49.49 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  48.57 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  61.11 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  48.54 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>