More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0832 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  100 
 
 
105 aa  216  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  87.5 
 
 
104 aa  193  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4629  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0273149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4648  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4417  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4256  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4268  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4633  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0606  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4758  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4649  thioredoxin  72.82 
 
 
104 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4349  thioredoxin  71.84 
 
 
104 aa  150  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  73.79 
 
 
104 aa  148  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  59.62 
 
 
104 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  59.62 
 
 
104 aa  133  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  58.65 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  57.14 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  56.6 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  55.66 
 
 
106 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  55.34 
 
 
107 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  57.84 
 
 
106 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  57.69 
 
 
108 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  56.7 
 
 
106 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  46.08 
 
 
105 aa  120  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  53.06 
 
 
103 aa  120  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  54.72 
 
 
106 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  58.76 
 
 
106 aa  120  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  54.72 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  59.38 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  54.46 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  52 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  53 
 
 
104 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  56.7 
 
 
104 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  51.92 
 
 
107 aa  117  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  55.1 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  55.1 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  51.92 
 
 
107 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  50 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  63.41 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52 
 
 
107 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  55.56 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  62.2 
 
 
104 aa  114  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  52 
 
 
108 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  53.92 
 
 
104 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  54.81 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  54.84 
 
 
105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  50.98 
 
 
109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  52.88 
 
 
120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  53.92 
 
 
110 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  61.73 
 
 
104 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  55.32 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  51 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  50.98 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  54.84 
 
 
105 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  58.33 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  58.33 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  54.37 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  52 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  55 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  59.26 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  56.47 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  54.37 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  57.47 
 
 
109 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  50.51 
 
 
107 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  58.7 
 
 
106 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  57.83 
 
 
104 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  53.76 
 
 
104 aa  111  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  49 
 
 
124 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  56.82 
 
 
104 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  49 
 
 
107 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  48.45 
 
 
110 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  47.17 
 
 
106 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  62.2 
 
 
104 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  49 
 
 
107 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  49 
 
 
109 aa  110  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  52.43 
 
 
106 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>