More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0201 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  97.17 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  95.28 
 
 		 106 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  93.4 
 
 		 106 aa  202  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  87.74 
 
 		 106 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  86.79 
 
 		 106 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  84.91 
 
 		 106 aa  187  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  71.7 
 
 		 106 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  63.73 
 
 		 104 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  64.76 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  63.81 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  63.81 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  62.26 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  64.42 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  63.81 
 
 		 106 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  56.19 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  60.38 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  59.62 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  60.95 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  60.95 
 
 		 106 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  56.86 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  56.86 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  57.43 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  55.56 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  127  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  57.14 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  56.7 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  59.38 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  50.48 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  56.7 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  61.9 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  56.44 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  53.85 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  59.18 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  59.18 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  53.77 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  58.16 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  59.57 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  56.57 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  124  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  50.98 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  50.98 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  58.06 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  56 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  56 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  58.59 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>