More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2309 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  80.56 
 
 		 120 aa  190  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  79.63 
 
 		 108 aa  189  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  64 
 
 		 107 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  64 
 
 		 107 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  64 
 
 		 107 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  63 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  64 
 
 		 107 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  64 
 
 		 107 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  62 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  64 
 
 		 107 aa  150  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  63 
 
 		 107 aa  150  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  63 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  64 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  63 
 
 		 107 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  62 
 
 		 107 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  61 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  59.26 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  59 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  59 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  61 
 
 		 107 aa  144  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  59 
 
 		 109 aa  143  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  59 
 
 		 107 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  59 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  62.04 
 
 		 108 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  57.41 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  57.94 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  57.01 
 
 		 109 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  58.65 
 
 		 105 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  53.7 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  61 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  56.73 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  59.81 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  64.42 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  57.41 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  52.88 
 
 		 108 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  57.41 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  58.88 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  61.46 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  53.7 
 
 		 109 aa  133  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  63.46 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  63.46 
 
 		 104 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  54.55 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  52.78 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  53.85 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  53.7 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  52.78 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  54.63 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  57.58 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  54.21 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  56.73 
 
 		 110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  60.2 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  55.56 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  55.14 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  54.21 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  55.88 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  53.27 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  53.27 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.37 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  61.46 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  53.27 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  52.78 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  52.34 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  52.78 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  52.78 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  54.63 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  51.85 
 
 		 223 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  56.7 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  58.76 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  53.27 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  52.78 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  51.4 
 
 		 259 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  53.27 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>