More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0813 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  100 
 
 		 109 aa  226  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  95.41 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  91.74 
 
 		 114 aa  213  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  88.99 
 
 		 109 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  81.65 
 
 		 109 aa  200  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  84.91 
 
 		 108 aa  194  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  80.73 
 
 		 109 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  77.98 
 
 		 110 aa  187  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  61.76 
 
 		 115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  62.26 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  57.28 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  60.82 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  55.88 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  137  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  57 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  54.9 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  54.9 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  54.9 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  56 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  56.31 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  56 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  56 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  53.4 
 
 		 107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  57 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  57 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  58 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  57 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  54.72 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  58.49 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  52.94 
 
 		 124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  52.73 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  52.48 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  56 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  60.42 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  56 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  58.49 
 
 		 104 aa  127  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  56.6 
 
 		 104 aa  127  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  49.07 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  49.07 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  49.07 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  55.66 
 
 		 104 aa  127  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  57.28 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  55.66 
 
 		 104 aa  127  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  57 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  54.72 
 
 		 104 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  55 
 
 		 110 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  56.57 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  57 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  57 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  57.28 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  55.34 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  54.72 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  52.78 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  54.55 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  46.73 
 
 		 259 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.56 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  53.4 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  51.38 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  52 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  52 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  51 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  49.51 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  52.53 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  49 
 
 		 123 aa  123  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>