More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1908 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  218  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  80.19 
 
 		 106 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  74.53 
 
 		 107 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  73.58 
 
 		 107 aa  176  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  74.53 
 
 		 107 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  73.58 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  69.15 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  57.28 
 
 		 107 aa  141  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  57.84 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  57.43 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  57.84 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  61.76 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  57.43 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  68.89 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  59.22 
 
 		 109 aa  140  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  63.04 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  58.25 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  58.25 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  54.37 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  55.88 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  58.65 
 
 		 109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  55.88 
 
 		 109 aa  137  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  58.65 
 
 		 109 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  59.18 
 
 		 109 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  58.25 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  59.41 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  52.88 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  56 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  54.37 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  56 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  56 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  58.25 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  56 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  61.86 
 
 		 109 aa  133  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  56 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  56.7 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  60.61 
 
 		 105 aa  133  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  55.24 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  59.41 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  57.73 
 
 		 110 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  54.29 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  59.18 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  59.14 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  58 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  59.18 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  56.84 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  59.18 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  53 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  60 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  58.76 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  58.51 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  53 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.57 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  55.67 
 
 		 110 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  56.57 
 
 		 106 aa  129  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  56.86 
 
 		 105 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  52 
 
 		 109 aa  129  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  57.73 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  55.67 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  49.04 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  58.76 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  58.76 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  61.86 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  53.54 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  56.12 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  55.45 
 
 		 108 aa  127  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  57.45 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  54.74 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  53.06 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  54.08 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  53.54 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>