More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1204 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  210  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  210  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  94.23 
 
 
104 aa  203  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  59.8 
 
 
110 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  56.73 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  59.62 
 
 
105 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  63.46 
 
 
108 aa  133  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  57.69 
 
 
104 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  56.86 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  61.54 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  60.58 
 
 
108 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  58 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  60 
 
 
109 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  57 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  56 
 
 
114 aa  123  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  56.86 
 
 
107 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  56.86 
 
 
107 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  57 
 
 
108 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  54.46 
 
 
106 aa  121  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  54.29 
 
 
107 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.86 
 
 
125 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  55 
 
 
109 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  58 
 
 
115 aa  120  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  53 
 
 
109 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  54.29 
 
 
107 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  56 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  55.45 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  56.6 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  55.24 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  57.84 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  53.61 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  50.49 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  52.48 
 
 
148 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  51.46 
 
 
141 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  53.54 
 
 
109 aa  118  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  58.76 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  57.69 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  55 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  53 
 
 
108 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  116  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  53.47 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  58.76 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  50.49 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  49.02 
 
 
259 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  53 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  54.9 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  53.06 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  60.24 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  54.64 
 
 
102 aa  114  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  56.73 
 
 
104 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  58.33 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  54 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  53.92 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  51.92 
 
 
108 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  50.5 
 
 
105 aa  114  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  48.51 
 
 
238 aa  114  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  55.45 
 
 
110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  52.43 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  53.47 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  56.12 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  55 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  52.88 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  52 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  53.57 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  49.51 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  52 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0606  thioredoxin  55.77 
 
 
104 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4648  thioredoxin  55.77 
 
 
104 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  51.49 
 
 
123 aa  111  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  52 
 
 
106 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4633  thioredoxin  55.77 
 
 
104 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>