More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9377 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  217  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  82.24 
 
 
107 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  66.36 
 
 
107 aa  157  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  67.29 
 
 
108 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  67.29 
 
 
108 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  66.36 
 
 
108 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  66.99 
 
 
108 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  63.11 
 
 
107 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  60.75 
 
 
107 aa  148  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  63.21 
 
 
108 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  60.75 
 
 
107 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  60.75 
 
 
108 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  66.02 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  57.94 
 
 
109 aa  143  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  61.76 
 
 
108 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  64.71 
 
 
108 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  57.94 
 
 
109 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  61.32 
 
 
116 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  60.75 
 
 
107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  61.39 
 
 
106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  54.72 
 
 
106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  59.41 
 
 
112 aa  136  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  56.19 
 
 
106 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  58.49 
 
 
109 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  60.78 
 
 
106 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  58.49 
 
 
109 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  58.49 
 
 
109 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  58.82 
 
 
109 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  58.82 
 
 
110 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  54.72 
 
 
108 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  61.17 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  56.73 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  58.76 
 
 
106 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  57.84 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  61.39 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.44 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  56.86 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  56.86 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  56.7 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  56.12 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  56.86 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  52.94 
 
 
113 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  57.73 
 
 
106 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  55.67 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  56.44 
 
 
146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  56.7 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  58.59 
 
 
124 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  57.43 
 
 
108 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  58.59 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  55.88 
 
 
119 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  55.77 
 
 
106 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  59.38 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  57.73 
 
 
106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  54.37 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  55.45 
 
 
146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  54.37 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  54.37 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  58.59 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  54.46 
 
 
106 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  54.37 
 
 
106 aa  124  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  52.38 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  54.81 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  58.95 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  61.29 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  57.29 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  61.29 
 
 
106 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  61.29 
 
 
106 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>