More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4407 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  100 
 
 
113 aa  231  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  61.9 
 
 
109 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  61.9 
 
 
109 aa  147  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  57.01 
 
 
110 aa  141  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  53.33 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.27 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  50.94 
 
 
115 aa  130  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  54.46 
 
 
123 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  52.34 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.21 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  53.12 
 
 
148 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  50.98 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  56.31 
 
 
105 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  54.64 
 
 
107 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  51.82 
 
 
109 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  53.4 
 
 
105 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  51.02 
 
 
107 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  54.08 
 
 
105 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  52.08 
 
 
109 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  50 
 
 
114 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  50.96 
 
 
106 aa  120  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  57.3 
 
 
108 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  57.78 
 
 
106 aa  120  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  49 
 
 
259 aa  120  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  50 
 
 
223 aa  120  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  47.57 
 
 
259 aa  120  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  52.58 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  50 
 
 
257 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  54.26 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.18 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  57.89 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  50.49 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  50.52 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  53.4 
 
 
110 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  54.35 
 
 
108 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  51.4 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  45.19 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  49.52 
 
 
110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  48.57 
 
 
110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  53.4 
 
 
108 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  45.19 
 
 
107 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  45.19 
 
 
107 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  47.57 
 
 
105 aa  117  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  51.4 
 
 
106 aa  117  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  54.35 
 
 
109 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  49.04 
 
 
112 aa  116  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  49.52 
 
 
109 aa  116  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  48.6 
 
 
105 aa  116  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  52.58 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  50.48 
 
 
109 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  45.19 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  49.02 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  52.53 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  51.43 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  47.12 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  53.54 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  49.04 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  51.43 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  49.53 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  52.38 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  50.52 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  45.79 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  45.63 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  54.64 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  45.79 
 
 
107 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  51.46 
 
 
108 aa  114  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  49.46 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  48.57 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  52.48 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  49.51 
 
 
108 aa  114  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  47.66 
 
 
108 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  48.54 
 
 
107 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>