More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1625 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  223  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  65.74 
 
 
223 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  58.88 
 
 
109 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  58.88 
 
 
109 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.62 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  61.96 
 
 
109 aa  131  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  56.6 
 
 
109 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  54 
 
 
103 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  57 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  60.87 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  53.47 
 
 
123 aa  128  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.5 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  52.48 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  49.07 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  48.6 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  47.22 
 
 
112 aa  125  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  47.22 
 
 
112 aa  125  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  56.7 
 
 
109 aa  124  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  52.78 
 
 
108 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  49.53 
 
 
109 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  48.57 
 
 
125 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  123  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.96 
 
 
107 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.96 
 
 
107 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  53.06 
 
 
105 aa  123  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  46.3 
 
 
108 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  51.96 
 
 
108 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  49.07 
 
 
108 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  55 
 
 
105 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  46.73 
 
 
109 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  46.73 
 
 
109 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  50.47 
 
 
109 aa  120  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  120  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  52.69 
 
 
107 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  49.51 
 
 
107 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  46.3 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  50.93 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  48 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  56.84 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  51.46 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  54.37 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  51.61 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  50.93 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  49.04 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  52.53 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  44.44 
 
 
108 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  51.49 
 
 
105 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  49.49 
 
 
108 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  47.22 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  46.3 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  45.71 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  54.37 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  54.64 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  51.49 
 
 
110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  50.49 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  48.62 
 
 
133 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  45.37 
 
 
112 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  45.37 
 
 
108 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  46.3 
 
 
108 aa  117  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>