More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0984 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  100 
 
 
110 aa  229  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  55.24 
 
 
110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  54.37 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  52.43 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  52.53 
 
 
107 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  52.38 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  51.43 
 
 
109 aa  127  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  50 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  50 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  52.43 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  52.04 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  52.43 
 
 
105 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  50.51 
 
 
107 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  50.91 
 
 
110 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  51.49 
 
 
109 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  50.49 
 
 
108 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  47.57 
 
 
108 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  49.11 
 
 
115 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  120  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  50 
 
 
114 aa  120  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  50 
 
 
150 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  48.54 
 
 
108 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  49.51 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  48.54 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  51.02 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  47.27 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  47.27 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  47.27 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  48.57 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  48.54 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  47.27 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  47.27 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.46 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  47.27 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  47.27 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  50.49 
 
 
109 aa  118  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  51.49 
 
 
124 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  45.63 
 
 
109 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  51.43 
 
 
109 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  48.54 
 
 
108 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  48.54 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  50.98 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  54.26 
 
 
259 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50.5 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  52.43 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  48.57 
 
 
113 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  47.57 
 
 
108 aa  117  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.55 
 
 
148 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  45.1 
 
 
107 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  53 
 
 
109 aa  117  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  51.46 
 
 
106 aa  117  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  49.51 
 
 
107 aa  116  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  49.51 
 
 
107 aa  116  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  46.36 
 
 
146 aa  116  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  49.51 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  46.3 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  115  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  47.57 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  48.51 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  48.54 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  48.57 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  48.57 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  47.57 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  50.52 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  49 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  46.6 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  48.54 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  49.02 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  51 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  42.86 
 
 
113 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>