More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_2021 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2105  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  216  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  216  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  98.13 
 
 
107 aa  213  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  73.83 
 
 
107 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  76.42 
 
 
106 aa  168  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  72.82 
 
 
107 aa  167  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  73.58 
 
 
106 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  71.96 
 
 
107 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  65.42 
 
 
107 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  71.7 
 
 
106 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  65.42 
 
 
107 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  66.98 
 
 
119 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  66.98 
 
 
106 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  66.98 
 
 
106 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  66.36 
 
 
107 aa  157  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  62.62 
 
 
107 aa  153  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  59.05 
 
 
106 aa  143  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  56.19 
 
 
106 aa  143  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  60.78 
 
 
106 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  59.05 
 
 
106 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  58.1 
 
 
106 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  59.05 
 
 
106 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  58.1 
 
 
106 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  59.05 
 
 
106 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  59.05 
 
 
106 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  62.38 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  56.19 
 
 
106 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  57.14 
 
 
106 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  56.19 
 
 
106 aa  136  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  59.8 
 
 
106 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  59.8 
 
 
106 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  60 
 
 
106 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  54.46 
 
 
104 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  63.37 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  58 
 
 
109 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  59.22 
 
 
107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  52.38 
 
 
106 aa  133  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  55.34 
 
 
133 aa  133  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  59.8 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  56.12 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  54 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  51.96 
 
 
111 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  60 
 
 
110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  56.86 
 
 
108 aa  130  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  58.65 
 
 
106 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  58.1 
 
 
106 aa  130  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  56.44 
 
 
105 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  53.92 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  57 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  56.84 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  57.89 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  56.57 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  55.45 
 
 
150 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  52.04 
 
 
107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  55.1 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  53.92 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  55.34 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  55.34 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  55.1 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  56.44 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  54.08 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  51 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  55.1 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  53.61 
 
 
108 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>