More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4761 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  100 
 
 
110 aa  227  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  81.9 
 
 
108 aa  186  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  74.77 
 
 
107 aa  179  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  73.83 
 
 
107 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  72.9 
 
 
107 aa  173  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  70.64 
 
 
109 aa  172  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  70.09 
 
 
148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  72.9 
 
 
107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  70.09 
 
 
107 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  69.16 
 
 
124 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  67.29 
 
 
107 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  67.29 
 
 
107 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  69.16 
 
 
107 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  68.22 
 
 
107 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  71.03 
 
 
107 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  68.22 
 
 
107 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  68.22 
 
 
107 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  68.22 
 
 
107 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  69.16 
 
 
107 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  69.16 
 
 
107 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  66.36 
 
 
107 aa  161  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  65.05 
 
 
123 aa  158  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  64.76 
 
 
125 aa  156  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  62.14 
 
 
105 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  56.73 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  55.77 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  59.62 
 
 
108 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  57.55 
 
 
110 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.33 
 
 
110 aa  134  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.79 
 
 
115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  55.34 
 
 
106 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  56 
 
 
106 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  54.72 
 
 
108 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  52.83 
 
 
107 aa  133  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  54.81 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  55.14 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  57.58 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  56.73 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  53 
 
 
109 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  53.21 
 
 
109 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  57.01 
 
 
108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  54.81 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  58.1 
 
 
116 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  55.21 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  53.77 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  54.29 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  54.13 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  57.43 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  57.43 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  57.43 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  54.08 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  51.92 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  54.17 
 
 
107 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  51.89 
 
 
108 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  54.21 
 
 
107 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  50.96 
 
 
110 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  52.83 
 
 
108 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  51.89 
 
 
108 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  50.96 
 
 
109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  54.81 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  56 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  49.06 
 
 
108 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  49.04 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  126  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  51.96 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  49.06 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  51 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  52.48 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  53.47 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  48.08 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  55.24 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  52.83 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  53.4 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  57.28 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  53.85 
 
 
110 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  53.12 
 
 
107 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  47.71 
 
 
109 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  49.06 
 
 
107 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  51 
 
 
109 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  54.17 
 
 
106 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  52 
 
 
109 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  49.02 
 
 
107 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>