More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1476 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  65.74 
 
 
108 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  62.38 
 
 
108 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  62.14 
 
 
109 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  28.8 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  30.31 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  30.52 
 
 
257 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  53.77 
 
 
107 aa  134  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  60.61 
 
 
109 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  60 
 
 
115 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  57.69 
 
 
105 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  57.43 
 
 
148 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  30.57 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  53.92 
 
 
123 aa  128  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  55.45 
 
 
124 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.06 
 
 
107 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  54.72 
 
 
107 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  55.34 
 
 
105 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  49.07 
 
 
108 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  58.7 
 
 
103 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  56.52 
 
 
109 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  45.22 
 
 
125 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  48.15 
 
 
120 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  60.67 
 
 
110 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  52.43 
 
 
109 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  60.82 
 
 
105 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  121  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.48 
 
 
107 aa  121  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  50.49 
 
 
108 aa  121  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  48.57 
 
 
109 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  53.06 
 
 
109 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  49.07 
 
 
110 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  50 
 
 
113 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  52.48 
 
 
112 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  55.43 
 
 
109 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  51.49 
 
 
146 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  53.06 
 
 
108 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  50.52 
 
 
109 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  49.52 
 
 
107 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  48.57 
 
 
107 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  50.5 
 
 
146 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  55.32 
 
 
110 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  50.5 
 
 
108 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  51.4 
 
 
109 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  43.4 
 
 
106 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  45.87 
 
 
112 aa  117  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  45.87 
 
 
112 aa  117  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  46.15 
 
 
106 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  49.07 
 
 
110 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  45.28 
 
 
109 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  47.92 
 
 
107 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  53.61 
 
 
106 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  49.51 
 
 
109 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  47.57 
 
 
112 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  54.35 
 
 
105 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  47.52 
 
 
108 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  52 
 
 
106 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  50.49 
 
 
105 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  48.08 
 
 
106 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  48.15 
 
 
108 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  44.66 
 
 
107 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  50.94 
 
 
110 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>