More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1003 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1831  thioredoxin  67.59 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  52.43 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  52.43 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  55.32 
 
 		 223 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  55.79 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  49.49 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  52.63 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.55 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.55 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  48.15 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  56.52 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52.58 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  48 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  55.91 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46.94 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  49.48 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  45.92 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  45.92 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45.92 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  50.54 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  52.13 
 
 		 105 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  56.25 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.15 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.15 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  51.58 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  48 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  50.52 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  50.54 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  51.61 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  48.39 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  47.47 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  50.56 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  50.54 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  46.15 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  46.46 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  46.88 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  43.3 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  45.36 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  47 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  48.39 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  47.83 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  49.46 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  49.49 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  49.47 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  104  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  48.98 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  42.11 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  47.06 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  44.79 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  50.51 
 
 		 302 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  49.47 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  48.91 
 
 		 109 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  52.13 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  47.87 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  50.53 
 
 		 109 aa  103  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  47 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  47 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  50.52 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  44.33 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  44.21 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  51.69 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  44.79 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  47.42 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  48.45 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  51.09 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  48.48 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  43 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>