More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1831 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1831  thioredoxin  100 
 
 		 116 aa  228  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  67.59 
 
 		 110 aa  153  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  54.37 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  54.37 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.51 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  54.55 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51.52 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  50 
 
 		 223 aa  116  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  49.49 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  49.49 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50.51 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50.51 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50.51 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  50.5 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  54.55 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  54.55 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  47.57 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50.49 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50.49 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  55.32 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48.48 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  53.61 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  50.52 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  57.29 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  48.48 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  52.08 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52.63 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  47.47 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50.47 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  49.48 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  55.91 
 
 		 108 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  47.47 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.52 
 
 		 107 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  52.63 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  46.46 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  49.46 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  49.04 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  52.13 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  48.04 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  45.92 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  47.52 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  48.48 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  53.76 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  51.04 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  49.5 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  53 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  48.45 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  47.96 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  49.53 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  53.68 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  52.53 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  53.68 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  45.54 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  49.48 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  49.47 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  46.88 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  54.74 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  48.04 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  44.66 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  46.81 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  50.52 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  46.53 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  50.52 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  52.63 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  50.52 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  52.63 
 
 		 106 aa  103  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  103  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  52.63 
 
 		 106 aa  103  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  47 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  47.52 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  49.47 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  48.45 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  48.04 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  47.42 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  47.47 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  47.42 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  50.55 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  52.63 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  49.47 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  44.55 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  49.47 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  47.92 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  46.53 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  50.53 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>