More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2950 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  214  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  97.17 
 
 		 106 aa  210  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  97.17 
 
 		 106 aa  210  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  78.3 
 
 		 106 aa  178  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  80.19 
 
 		 106 aa  177  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  79.05 
 
 		 107 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  76.42 
 
 		 106 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  65.38 
 
 		 107 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  64.76 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  64.76 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  63.81 
 
 		 106 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  62.26 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  63.81 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  63.46 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  59.05 
 
 		 107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  62.26 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  59.05 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  59.05 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  137  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  61.32 
 
 		 107 aa  136  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  57.43 
 
 		 104 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  61.39 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  63.54 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  58.49 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  57.28 
 
 		 110 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  55.24 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  55.24 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  54.29 
 
 		 111 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  54.29 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  57.43 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  57.55 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  58.25 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  61.29 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  54 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  54 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  54.46 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  56.44 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  51.49 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  127  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  54.46 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  53.47 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.31 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  54.29 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  56.44 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  56.7 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.29 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  58.16 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  60.95 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  54.29 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  57 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  55.45 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  51.89 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  53.47 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>