More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  223  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  62.96 
 
 		 108 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  60.75 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  62.04 
 
 		 108 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  61.11 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  61.11 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  55.14 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  55.24 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  52.78 
 
 		 109 aa  133  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  55.56 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.86 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  56.86 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.57 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  56.73 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  62.04 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  51.4 
 
 		 109 aa  129  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  55.88 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  53.27 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  58.1 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  63.83 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  56.31 
 
 		 259 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  52.78 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.44 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  51.49 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  56.88 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  55 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  61.96 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  56.57 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  57.45 
 
 		 108 aa  123  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  51.43 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  56.38 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  57.41 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  53.85 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  53.47 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.43 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  51.96 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  52.43 
 
 		 259 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  52.94 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  53.92 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  59.14 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  51.46 
 
 		 150 aa  120  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  54.72 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  58.7 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  47.27 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  60.87 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  51.96 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  53.47 
 
 		 110 aa  120  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  119  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  54.08 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  58.7 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  54.84 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  53.85 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  52.53 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  55.14 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  56.99 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  54.9 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  54.84 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>