More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7087 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  76.85 
 
 		 108 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  78.1 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  68.57 
 
 		 107 aa  161  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  69.23 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  68.87 
 
 		 109 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  68.87 
 
 		 109 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  68.87 
 
 		 109 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  68.87 
 
 		 109 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  67.92 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  66.67 
 
 		 110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  66.67 
 
 		 108 aa  153  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  68.57 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  63.46 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  66.67 
 
 		 111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  59.05 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  54.72 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  61.22 
 
 		 106 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  54.63 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  52.83 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  58.49 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  56.44 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  56.73 
 
 		 106 aa  129  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  56.44 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  56.31 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  60.2 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  58 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.81 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  53.33 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  49.52 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  55.79 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  53.33 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  53.33 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  53 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  56 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  56 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  52.43 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  51.52 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  55.45 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  52.38 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  48.54 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  52.48 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  48.62 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  57.43 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  53.06 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  55.77 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  49 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  55.67 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  48.98 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  50.52 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  50.52 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  55.45 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  51 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  57.78 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  55.56 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  53.76 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  51.49 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  51 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  54 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  52.08 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  49.49 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.49 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  56.25 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  50.54 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  53.47 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  49.46 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  51.55 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  51.55 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  51.55 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  50 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  49.49 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  54.64 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>