More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0031 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  220  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  58.65 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  55.77 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  56.48 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  57 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  57 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  57 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  53.77 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  57.14 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  53.92 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  52.83 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  56.19 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  55.88 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  53.77 
 
 		 114 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  57.41 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  56.12 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  54.29 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  51.52 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  55 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  53.06 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  54.64 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  52.04 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  52.48 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  52 
 
 		 259 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  51.49 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  53.47 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  54.37 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  49.52 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  52.04 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  47.62 
 
 		 109 aa  116  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  51.89 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  53 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  50.94 
 
 		 223 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  59.78 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  53.12 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  52.29 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  54.74 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.3 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  51.4 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  49.51 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  51.55 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  54.84 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  56.18 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  55.67 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  54.72 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  48.51 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  48.04 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  49.04 
 
 		 257 aa  113  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  53.76 
 
 		 106 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  50.98 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  52.48 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  52.04 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  51.49 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  50.5 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  53.76 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  48.45 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  48.08 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  49.04 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  50.51 
 
 		 259 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  50.5 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  51.58 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  53.19 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  55.91 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  54.84 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  53.4 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  51.61 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  49.48 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  51.61 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  49.46 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  51 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  47.42 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  54.74 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  50.54 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  50.54 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  50.5 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  55.91 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  50.51 
 
 		 238 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  55 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  49.5 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  55 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  54.84 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  55.91 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>