More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4233 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  100 
 
 		 111 aa  219  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  69.37 
 
 		 109 aa  156  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  69.37 
 
 		 109 aa  156  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  69.37 
 
 		 109 aa  156  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  66.35 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  66.67 
 
 		 110 aa  153  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  66.98 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  66.98 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  66.98 
 
 		 109 aa  151  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  64.76 
 
 		 108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  66 
 
 		 108 aa  143  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  58.49 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  55.45 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  60 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  54.29 
 
 		 107 aa  129  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  54.05 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  54.72 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  56.19 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  57.69 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  56.07 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  55.67 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  52.88 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.46 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  52.29 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  52.43 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  56.86 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  54.64 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  53.85 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  54.74 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  52.78 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  54.9 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  52.25 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  54.05 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  52.94 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  52.94 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  55 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  50.94 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  49.51 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  57.69 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  51.43 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  50.49 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  53.54 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  52.48 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  53.85 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  50.96 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  115  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  52.48 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  52.48 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  52.69 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  50.49 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  55.24 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  53 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  55.24 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  52.69 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  53.33 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  52.69 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  54.74 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  53.76 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  52.63 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  53.61 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  57.14 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  54.84 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  51.55 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  45.54 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  47.62 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  52.94 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  51.58 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  52.43 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>