More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3849 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  220  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  54.37 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50.49 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  53.54 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  59 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.85 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  47.57 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  47.12 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  48.51 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  57.89 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  54 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  50.48 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  51.96 
 
 		 105 aa  124  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  53.4 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  51.46 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  45.37 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  57.28 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  51.46 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  51.4 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  54.46 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  49.02 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  54.37 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  53.33 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  45.71 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  51.43 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  51.02 
 
 		 110 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  49.51 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  53.68 
 
 		 107 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  48 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  52 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  50.49 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  51.85 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  48.98 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  43.4 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  49.51 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  55.34 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  53.4 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  48.6 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  51 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  49.07 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  55.34 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  51.52 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  48.51 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  49.02 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  53.68 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  49.04 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  54 
 
 		 238 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  51.46 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  50.51 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>