More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1456 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  100 
 
 
109 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  100 
 
 
109 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  98.17 
 
 
109 aa  218  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  81.82 
 
 
110 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  58.18 
 
 
110 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  54.13 
 
 
109 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  57.94 
 
 
108 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  58.25 
 
 
108 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  57.43 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  55.05 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  65.17 
 
 
115 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  55.05 
 
 
109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  56.38 
 
 
109 aa  130  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  57.84 
 
 
123 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  59.6 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  50.91 
 
 
110 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  55.96 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  58.42 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  54.13 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  57.43 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  54.37 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  63.22 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  57.58 
 
 
107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  55.45 
 
 
109 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.83 
 
 
107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  54.37 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  53.21 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  54.29 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  54.46 
 
 
124 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  54.13 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  55.91 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  62.07 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  50.47 
 
 
109 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  51.4 
 
 
108 aa  124  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  56.99 
 
 
108 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  54.55 
 
 
107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  54.37 
 
 
107 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  57.43 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  55.79 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  60.87 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  54.74 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  54.21 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  54.74 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  53.21 
 
 
109 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  58.06 
 
 
108 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  124  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  52.83 
 
 
125 aa  123  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  123  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  53.68 
 
 
109 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  50.47 
 
 
108 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  51.4 
 
 
108 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.38 
 
 
120 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  50.47 
 
 
108 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  52.34 
 
 
108 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  56.52 
 
 
108 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  58.43 
 
 
105 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  53.47 
 
 
109 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  55.91 
 
 
108 aa  121  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  53.68 
 
 
110 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  52.63 
 
 
110 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  55.06 
 
 
110 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  52.69 
 
 
108 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  54.74 
 
 
109 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.54 
 
 
107 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  53.68 
 
 
116 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  53.76 
 
 
108 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.54 
 
 
107 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  55.91 
 
 
108 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  53.76 
 
 
108 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  53.68 
 
 
109 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  53.68 
 
 
109 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  57.65 
 
 
106 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  57.47 
 
 
106 aa  120  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  51.58 
 
 
133 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  49.53 
 
 
108 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  53.68 
 
 
109 aa  119  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  53.76 
 
 
108 aa  119  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  53.76 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  51.58 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  54.63 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  53.76 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  49.54 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>