More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3070 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  42.06 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  44.12 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  46.46 
 
 		 259 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  43.88 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  40.95 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  40.95 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  40.95 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  42.27 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  43.81 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  44.68 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  50 
 
 		 259 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  42.72 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  46.34 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  42.86 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  40.2 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  45.12 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.67 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  46.74 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.81 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  51.19 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  43.81 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  51.25 
 
 		 257 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  44.12 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  46.32 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  41.05 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  43.88 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  40.82 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46.81 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  38.46 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  46.67 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  43.14 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  47.06 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  43.81 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  45.45 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  42.72 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  41.67 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  48.28 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  39.05 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  47.56 
 
 		 107 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  47.25 
 
 		 238 aa  90.9  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45.24 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  45.92 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  45.24 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  43.62 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  45.24 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  44.09 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  41.18 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  40.95 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  42.55 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.62 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  40.82 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  46.25 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  42.72 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  45.88 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  45.65 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  45.56 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  45.45 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  43.53 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  40.2 
 
 		 289 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  47.56 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  46.81 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  43.53 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  40.2 
 
 		 289 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  37.38 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  47.5 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  43.37 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  46.39 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  42.35 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  36.84 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  37.38 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  44.05 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.05 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44.05 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.84 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  40.62 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  48.72 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  44.19 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  40.45 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  41.67 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  38.1 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  40.91 
 
 		 310 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  40.43 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>