More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2848 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  44.95 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  40.57 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  39.93 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  38.65 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  38.08 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  36.75 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  37.81 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  38.43 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  40.14 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.08 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.73 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.73 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  35.64 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  37.68 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  37.72 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  37.32 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.38 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.38 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  38.1 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  38.25 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  39.72 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  37.37 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  38.6 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  36.68 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.73 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.03 
 
 		 918 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.33 
 
 		 290 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  39.08 
 
 		 282 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  39.08 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  38.78 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  36.61 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  39.32 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  36.68 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  37.68 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  38.85 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.38 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  37.41 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.99 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.68 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  38.75 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  36.71 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.12 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  37.41 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.6 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.92 
 
 		 287 aa  171  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  35.64 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  35.12 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  35.92 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  35.59 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  37.02 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  34.78 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  35.51 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  34.48 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  37.89 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  34.19 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  31.36 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  31.36 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.28 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  34.77 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  34.02 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  33.68 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.37 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  33.79 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  36.14 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  35.74 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  33.33 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  34.31 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  36.88 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  35.76 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  34.11 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.23 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  32.61 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  32.51 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  31.79 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  33.68 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.94 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  33.57 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  29.61 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  32.3 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  59.41 
 
 		 110 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  30.69 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  31.49 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  33.33 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  31.9 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  30 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.16 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  31.65 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  32.38 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  33.33 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  29.31 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  32.5 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  33.33 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  32.5 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  30.45 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  36.4 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  32.76 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  32.76 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>