More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2527 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  100 
 
 		 293 aa  586  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  89.42 
 
 		 293 aa  517  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  55.21 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  42.81 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  41.84 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  40 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  41.7 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  39.93 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  40.75 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  42.91 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  38.91 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  42.76 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  42.61 
 
 		 282 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  40.42 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  40.13 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  42.16 
 
 		 282 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  40.77 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  38.7 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  38.31 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  41.81 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  39.46 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  39.46 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  38.91 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  41.18 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  37.25 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  40.77 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  37.58 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  42.66 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  42.66 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  42.86 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  39.5 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  37.84 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  39.13 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  38.91 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  38.01 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  37.85 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  38.1 
 
 		 324 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  40.56 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  42.27 
 
 		 918 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  39.33 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  39.66 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  38.68 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  39.25 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  41.84 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  40.14 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  36.7 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  38.44 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  35.52 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  35.52 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  37.07 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  41.49 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  37.46 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  40.77 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  37.82 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  39.79 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  37.84 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  37.33 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  37.33 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.94 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  38.46 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  35.88 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.08 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  37.41 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  35.15 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  34.18 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.22 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  37.46 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  36.55 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  39.78 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  37.79 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  37.76 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  36.77 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  36.71 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  37.94 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.84 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  40.53 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  34.72 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  33.77 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  33.11 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  32.12 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.87 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  39.18 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  35.66 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34.48 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  32.78 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.97 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  40.81 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  34.94 
 
 		 268 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.79 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.79 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  33.1 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.33 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.79 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  39.06 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  37.16 
 
 		 336 aa  148  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  50 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  36.01 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  35.4 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  36.4 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>