More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1982 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  100 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  58.19 
 
 		 306 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  57.14 
 
 		 305 aa  348  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  56.86 
 
 		 306 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  56.86 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  58.05 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  56.71 
 
 		 302 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  58.19 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  56.95 
 
 		 302 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  55.63 
 
 		 310 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  56.62 
 
 		 302 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  57.29 
 
 		 300 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  53.65 
 
 		 329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  57.53 
 
 		 306 aa  318  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  53.65 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  52.19 
 
 		 320 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  58.05 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  55.44 
 
 		 336 aa  308  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  51.37 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  54.48 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  56.19 
 
 		 302 aa  302  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  49.84 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  50 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  52.27 
 
 		 307 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  49.32 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  50.51 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  50.51 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  48.78 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  52.2 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  47.06 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  51.86 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  52.68 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  47.28 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  49.83 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  47.14 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  45.83 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  44.9 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  41.05 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  41.08 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  37.89 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  40.14 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  39.65 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  40.21 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  39.24 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  39.5 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  40.46 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  40.08 
 
 		 281 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  40.21 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  41.64 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36.81 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  37.15 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  40 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  39.24 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  38.87 
 
 		 280 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  38.21 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  36.81 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  40.14 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  40.14 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  39.86 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  36.96 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  37.91 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  35.56 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  35.76 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  39.79 
 
 		 282 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.79 
 
 		 282 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  36.96 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.79 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  39.86 
 
 		 918 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  35.87 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  39.5 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  37.85 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  41.18 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  39.15 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  39.15 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  36.62 
 
 		 290 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.98 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  36.27 
 
 		 289 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.81 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  36.93 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.64 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.19 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.74 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  34.71 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  36.42 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.41 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  37.09 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  32.67 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  35.56 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.69 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  32.56 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  33.22 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  32.75 
 
 		 285 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  33.97 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.84 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  34.39 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  32.69 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  33.22 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  33.11 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>