More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1925 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  591  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  55.28 
 
 
300 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  51.04 
 
 
297 aa  268  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  55.17 
 
 
300 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  48.55 
 
 
299 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  50.38 
 
 
321 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  46.44 
 
 
326 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  45.39 
 
 
312 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  45.69 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  42.15 
 
 
313 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  41.21 
 
 
311 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  47.01 
 
 
331 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  45.39 
 
 
329 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  37.12 
 
 
310 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  39.73 
 
 
301 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  38.89 
 
 
293 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  37.59 
 
 
293 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  35.39 
 
 
304 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  38.24 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  37.76 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  32.53 
 
 
334 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  36.63 
 
 
304 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  38.33 
 
 
323 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  36.64 
 
 
339 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  33.91 
 
 
338 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  40.94 
 
 
310 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  33.66 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  33.45 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.41 
 
 
280 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.3 
 
 
302 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  34.44 
 
 
304 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  36.31 
 
 
320 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  36.33 
 
 
311 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  38.04 
 
 
282 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  33.22 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.21 
 
 
310 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  32.88 
 
 
324 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  33.44 
 
 
320 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  32.89 
 
 
324 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  34.57 
 
 
334 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  32.56 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  33.22 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  33.1 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  33.22 
 
 
306 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  33.22 
 
 
317 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  34.83 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  34.18 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  34.83 
 
 
282 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  31.61 
 
 
304 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  34.03 
 
 
286 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  31.89 
 
 
303 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.07 
 
 
281 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  33.56 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  33.56 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  34.26 
 
 
301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  35.64 
 
 
918 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  34.48 
 
 
282 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  34.48 
 
 
282 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  33.81 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  35.43 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  34.02 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  34.89 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.26 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  33.91 
 
 
282 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  35.56 
 
 
313 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  31.05 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  31.37 
 
 
306 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  34.64 
 
 
285 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.8 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  30.72 
 
 
304 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  39.19 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.08 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  32.53 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  33.67 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  32.33 
 
 
306 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  32.39 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  32.39 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.14 
 
 
306 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  36.36 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.48 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  29.76 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  35.11 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  32.75 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  36.16 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  34.16 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  39.46 
 
 
333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  34.83 
 
 
282 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  33.45 
 
 
274 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.4 
 
 
286 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  33.83 
 
 
346 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  31.48 
 
 
302 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  32.6 
 
 
314 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.15 
 
 
286 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.83 
 
 
290 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>