More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00581 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  53.79 
 
 		 281 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  45.2 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  47.33 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  45.23 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  45.58 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  45.94 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  45.45 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  45.45 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  45.55 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  45.55 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  45.55 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  45.55 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  45.55 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  45.45 
 
 		 293 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  45.45 
 
 		 293 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  44.88 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  45.45 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  45.2 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  45.2 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  45.2 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  45.2 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  46.07 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  41.79 
 
 		 280 aa  231  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  43.71 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  43.71 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  43.71 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  40.64 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  40.93 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  39.07 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  44.13 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  40.42 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  40.77 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  39.21 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  40.42 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  41.26 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  35.46 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  37.19 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  38.54 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  37.41 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  40.35 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  37.76 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  39.1 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  37.54 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  39.86 
 
 		 281 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  37.63 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.93 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.11 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  40.42 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  35.23 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  38.43 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  36.59 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36.59 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  40.91 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  35.59 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  39.51 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.43 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  38.87 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  37.19 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  36.79 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  39.16 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  35.99 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.88 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  35.38 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.02 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.02 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  35.59 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.07 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  35.82 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  34.75 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  37.06 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.77 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  35.38 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  35.59 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  35.69 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  35.69 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  35.69 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.79 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  35.17 
 
 		 918 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  35 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  37.86 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.62 
 
 		 310 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  33 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  35.34 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  32.65 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  33.11 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  34.4 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  34.03 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  32.76 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  34.54 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  32.64 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  34.3 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  34.3 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  33.22 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  34.3 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  33.8 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  32.67 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  31.96 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  33.1 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  32.4 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>