More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2566 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  100 
 
 		 282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  99.65 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  98.94 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  94.68 
 
 		 282 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  92.91 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  92.91 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  93.26 
 
 		 282 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  84.75 
 
 		 301 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  84.4 
 
 		 918 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  85.11 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  85.11 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  84.04 
 
 		 282 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  69.4 
 
 		 282 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  70.21 
 
 		 282 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  69.75 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  83.41 
 
 		 229 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  60.64 
 
 		 280 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  58.01 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  56.23 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  53.02 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  53.38 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  47.87 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  42.95 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  44.48 
 
 		 302 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  42.62 
 
 		 326 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  43.14 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  42.81 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  39.81 
 
 		 314 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  40.07 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  40.94 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  40.21 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  40.93 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  43.12 
 
 		 312 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  40.62 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  39.4 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  38.73 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  38.73 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  40.99 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  42.25 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  38.33 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  40.42 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  41.9 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  39.72 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  38.75 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  38.33 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  39.37 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  41.11 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  39.37 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  38.51 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  39.72 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  38.81 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  38.06 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  38.46 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  40.27 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  39.5 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  37.41 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  38.33 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  38.46 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  39.25 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  38.04 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  37.5 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  37.68 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  37.23 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  37.72 
 
 		 306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  37.89 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  38.33 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  37.63 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  37.63 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  39.19 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  39.22 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  34.3 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  37.59 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  37.59 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  37.89 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  37.33 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  35.02 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  37.37 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  35.31 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  38.25 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  40.14 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  37.76 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  37.94 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  36.3 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  41.7 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  37.89 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  37.37 
 
 		 304 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  41.13 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  37.37 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  37.54 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  36.01 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  39.02 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  37.99 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  37.54 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.92 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  36.62 
 
 		 304 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  33.22 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  38.52 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  37.23 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  38.91 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>