More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1595 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  37.94 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  37.77 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  38.16 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  39.08 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.4 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  37.32 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  37.32 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  37.63 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  37.02 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  36.36 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  33.8 
 
 		 290 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  34.89 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.11 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  32.98 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  35.54 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.17 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  31.21 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.87 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1879  thioredoxin-related  31.79 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000713848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.92 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.64 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.22 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.05 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  32.64 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.71 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  31.79 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.99 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  33.22 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  32.16 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.62 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  31.69 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.99 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30.99 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  31.62 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  30.36 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  30.31 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  31.36 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  31.01 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  31.14 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  30.36 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.31 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30.63 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  31.23 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  32.06 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  30.9 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  29.64 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  32.06 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  32.16 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.79 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  31.25 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  29.02 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  32.51 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  32.51 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  32.51 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  31.56 
 
 		 302 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  30.9 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  33.11 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  28.97 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  30.9 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  32.06 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  33.1 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30.1 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  30.41 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  33.57 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  30.07 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  31.94 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  30.82 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  28.28 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  29.86 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  32.2 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  29.3 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  32.51 
 
 		 918 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  28.77 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  28.18 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  30.31 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  32.26 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  28.18 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  29.17 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  28.23 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  29.27 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  27.93 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  28.87 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  29.55 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  29.55 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  29.51 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  27.76 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  28.57 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  27.59 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  32.17 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  29.23 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  29.23 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  31.82 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  32.17 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  27.59 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>