More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0551 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  100 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  99.32 
 
 		 293 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  99.32 
 
 		 293 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  99.32 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  98.98 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  95.42 
 
 		 284 aa  547  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  95.42 
 
 		 284 aa  547  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  95.77 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  95.77 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  95.77 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  95.42 
 
 		 284 aa  547  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  95.77 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  95.77 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  95.42 
 
 		 284 aa  547  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  86.97 
 
 		 284 aa  504  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  73.2 
 
 		 294 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  71.79 
 
 		 286 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  71.97 
 
 		 289 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  71.97 
 
 		 289 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  71.97 
 
 		 289 aa  411  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  70.71 
 
 		 286 aa  408  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  71.79 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  67.5 
 
 		 286 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  49.29 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  45.89 
 
 		 334 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  46.13 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  46.24 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  42.91 
 
 		 306 aa  244  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  45.45 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  43.82 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  41.9 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  44.68 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  41.75 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  42.11 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  41.05 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  41.4 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  43.26 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  40.7 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  41.05 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  40.28 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  41.75 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  41.75 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  38.2 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  40.62 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  40.28 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  41.22 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  38.72 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  33.93 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.14 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  37.82 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  36.84 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36.24 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.79 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  35.44 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.24 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.49 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  37.59 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.84 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  33.33 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.04 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  35.89 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.49 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  36.9 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.98 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  35.32 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  34.07 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  30.85 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.07 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.07 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  34.56 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.99 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.56 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  32.85 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  32.73 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  29.33 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  32.37 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.58 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  29.86 
 
 		 324 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  32.88 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  33.82 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  33.82 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  30.04 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  31.67 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  34.19 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  34.56 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  31.16 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  30.67 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  30.6 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  34.07 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  34.07 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  32.25 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  32.25 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  32.56 
 
 		 918 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  31.88 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  33.58 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  30.67 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  28.27 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  31.56 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  29.97 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>