More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0498 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  53.52 
 
 		 334 aa  315  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  53.17 
 
 		 284 aa  308  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  49.65 
 
 		 284 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  45.45 
 
 		 286 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  45.1 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  42.91 
 
 		 293 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  42.66 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  43.55 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  43.55 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  42.91 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  43.55 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  43.55 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  43.55 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  43.55 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  43.55 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  43.55 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  43.55 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  42.57 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  42.57 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  42.57 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  43.36 
 
 		 286 aa  241  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  42.96 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  40.75 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  40.75 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  40.75 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  40.14 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  41.9 
 
 		 287 aa  205  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  41.55 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  41.2 
 
 		 287 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  41.4 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  40.49 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  37.72 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  35.46 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  38.11 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  37.5 
 
 		 287 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  36.88 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  39.3 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  36.94 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  38.95 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  39.36 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  39.78 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  38.95 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  38.6 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  35.48 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  35 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  39.07 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  34.15 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.22 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.75 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.86 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.51 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.22 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.11 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.98 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.45 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.25 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.92 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.45 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  29.89 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.49 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  31.94 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  30.25 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  30.25 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  29.54 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  30.42 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  30.25 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  30.14 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  30.77 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  31.12 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  29.97 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  29.47 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  29.63 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  28.33 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  28.33 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  28.42 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.07 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  28.17 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  27.78 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  28.27 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  28.27 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.93 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  25 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  28.06 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  27.82 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.61 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.18 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  26.6 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  26.26 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  25 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  26.87 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  28.43 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  28.78 
 
 		 280 aa  95.9  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  26.09 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  25.78 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  28 
 
 		 336 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  27.96 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  27.87 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>