More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2585 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  98.95 
 
 		 287 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  99.3 
 
 		 287 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  98.61 
 
 		 287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  83.97 
 
 		 287 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  82.93 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  83.62 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  83.28 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  85.71 
 
 		 287 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  61.67 
 
 		 287 aa  358  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  60.28 
 
 		 287 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  61.32 
 
 		 279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  62.37 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  62.85 
 
 		 281 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  62.72 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  52.46 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  42.86 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  42.51 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  42.51 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  42.51 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  42.51 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  42.51 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  41.46 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  43.16 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  41.11 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  41.11 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  41.11 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  40.85 
 
 		 334 aa  208  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  41.11 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  40.42 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  38.95 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  39.3 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  39.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  40.85 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  38.38 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  39.79 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  36.49 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  36.71 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  36.9 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  36.9 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  36.9 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  35.76 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  37.15 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  35.66 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.1 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  32.76 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  30.29 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  32.76 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  31.6 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.07 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.99 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.51 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  31.32 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  31.38 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  31.6 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  31.38 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.75 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  28.57 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  30.71 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  28.03 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.31 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  29.9 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  29.51 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.14 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  27.9 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  30.74 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  29.61 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  25.64 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  25.44 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  26.9 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  29.75 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  26.62 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  27.34 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  26.06 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  42.06 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  28.88 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  42.06 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  28.21 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  28.32 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  27.01 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  27.82 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  27.82 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  26.41 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  26.57 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  25.09 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.15 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  26.92 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.5 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  25.35 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  27.34 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  27.24 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  26.57 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  29.89 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  29.83 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  26.37 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  26.57 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>