More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004149 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  87.32 
 
 		 334 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  58.1 
 
 		 284 aa  321  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  53.17 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  46.95 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  46.95 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  46.95 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  46.95 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  46.95 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  46.59 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  46.59 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  46.59 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  46.59 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  46.24 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  45.88 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  45.88 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  45.88 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  46.59 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  45.88 
 
 		 293 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  43.46 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  46.24 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  42.76 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  42.76 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  44.52 
 
 		 286 aa  234  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  43.49 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  43.49 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  43.49 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  40.64 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  40.14 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  39.79 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  40.7 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  40.5 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  40.49 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  40.49 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  40.49 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  40.14 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  39.07 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  41.2 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  39.43 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  41.55 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  39.43 
 
 		 281 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  37.14 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  36.36 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  38.38 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  39.08 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  40.14 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  37.08 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  38.19 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  38.19 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.75 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  31.82 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  33.68 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.52 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.34 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.07 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30.07 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.77 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.31 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.58 
 
 		 289 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  31.01 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  29.27 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  31.45 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.33 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  28.92 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  29.62 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.52 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  27.56 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  30.69 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  28.12 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  28.03 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  28.03 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  26.95 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  28.42 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  27.78 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  27.68 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  27.84 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  28.62 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  29.29 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  29.96 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  26.99 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  26.22 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  26.57 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  26.57 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  25.95 
 
 		 306 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.11 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.79 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  28.89 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  29.37 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  24.83 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  29.07 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  28.42 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  27.84 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  28.37 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25.95 
 
 		 330 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  25.43 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  28.72 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  28.31 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  29.45 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  29.11 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  25.52 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>