More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3775 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  100 
 
 		 324 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  92.28 
 
 		 324 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  74.1 
 
 		 334 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  72.12 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  56.27 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  56.57 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  54.32 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  55.74 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  52.69 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  55.41 
 
 		 306 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  55.52 
 
 		 305 aa  328  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  54.05 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  51.46 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  54.33 
 
 		 300 aa  309  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  54.61 
 
 		 304 aa  308  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  51.46 
 
 		 302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  52.46 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  52.46 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  53.56 
 
 		 306 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  50.51 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  50.17 
 
 		 317 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  53.38 
 
 		 305 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  52.36 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  50.67 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  50.89 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  48.16 
 
 		 304 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  47.46 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  43.45 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  41.64 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  41.45 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  43.48 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  42.11 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  42.11 
 
 		 304 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  41.32 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  41.78 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  39.46 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  39.6 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  42.01 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.72 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  40.42 
 
 		 282 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  39.37 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  41.11 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.11 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  40.07 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  41.32 
 
 		 282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  40.07 
 
 		 282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  39.3 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  38.06 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.68 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  38.44 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.98 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.98 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.07 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.98 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.98 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  36.68 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.72 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  35.42 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  36.15 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  39.93 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.85 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  39.93 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  38.3 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  39.16 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  39.24 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.18 
 
 		 286 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  35.37 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.53 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.89 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  39.24 
 
 		 918 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  36.86 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36.18 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.03 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  33.23 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.56 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  35.49 
 
 		 290 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  35.96 
 
 		 289 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  35.18 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.18 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  34.42 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  35.44 
 
 		 277 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.22 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.26 
 
 		 269 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  34.1 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.3 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  33.57 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  35.82 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  33.44 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  35.05 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.77 
 
 		 286 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  34.93 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  32.65 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  32.41 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  30.74 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  30.48 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  34.26 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  31.61 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  35.02 
 
 		 263 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  30.07 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  34.69 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>