More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0603 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  43.55 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  39.02 
 
 		 287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  40.97 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  41.92 
 
 		 289 aa  214  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  40.41 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  40.97 
 
 		 290 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  40.21 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  40.28 
 
 		 290 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  38.83 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  41.5 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  40.28 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  39.93 
 
 		 290 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  38.68 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  44.13 
 
 		 291 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  36.59 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  41.84 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  37.77 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  39.02 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  37.11 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  37.11 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  37.41 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.2 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  33.94 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  37.28 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  37.28 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  37.28 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  37.28 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  37.28 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  35.74 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  33.21 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.8 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  36.93 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  36.93 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  36.93 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  36.93 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.86 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  35.54 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.31 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  33.21 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  33.33 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.31 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  33.1 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.84 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  37.37 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  32.27 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  35.89 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  35.89 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  35.89 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  35.89 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  35.15 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  35.89 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  32.52 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.33 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.62 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  35.54 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  33.69 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  35.31 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  35.23 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  35.54 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  34.95 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  34.75 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  34.97 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  34.97 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  34.16 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  29.27 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  31.12 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  31.12 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  34.97 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  32.85 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  34.4 
 
 		 282 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  34.4 
 
 		 282 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32.96 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  34.04 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  33.45 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  30.6 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1879  thioredoxin-related  29.6 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000713848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  34.04 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  30.34 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  32.96 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  32.98 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.07 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  32.16 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  29.31 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  32.59 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  34.04 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  33.57 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  31.12 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  34.04 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  34.04 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  28.04 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  29.62 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  33.81 
 
 		 918 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  32.27 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  35 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  31.82 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  28.03 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  31.47 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  31.45 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  31.47 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>