More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0804 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  100 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  59.51 
 
 		 334 aa  329  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  58.1 
 
 		 284 aa  321  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  49.65 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  46.83 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  46.83 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  46.83 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  46.83 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  46.83 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  46.48 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  46.48 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  46.48 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  46.48 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  46.13 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  45.77 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  45.77 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  45.77 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  45.77 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  42.81 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  44.37 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  44.01 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  41.73 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  42.21 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  42.21 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  42.21 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  39.93 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  41.34 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  39.79 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  39.07 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  38.65 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  39.22 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  38.46 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  38.46 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  37.31 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  37.81 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  37.41 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  37.06 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  37.46 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  37.1 
 
 		 287 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  37.1 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  35.13 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  36.71 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  38.3 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  35.97 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  37.76 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  37.1 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  37.41 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  36.04 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.21 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.75 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.23 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  31.45 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.21 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.65 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  29.31 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.66 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30.04 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  29.66 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.22 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  29.23 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  29.29 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  29.58 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  33.1 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.26 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  28.93 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  27.37 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  28.16 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  28.32 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  30.07 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  26.3 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.83 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  27.3 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.3 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  27.27 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.13 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  26.6 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  26.33 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  25.87 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  27.24 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.34 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  28.28 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  25.9 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  27.37 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  27.14 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  27.54 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  27.01 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  27.08 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  27.21 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  25.9 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  26.64 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  26.64 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  25.27 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  26.22 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  26.47 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  26.5 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  26.49 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  26.12 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  25.9 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  26.6 
 
 		 334 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>