More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2231 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  553  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  63.76 
 
 		 287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  63.41 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  63.41 
 
 		 287 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  63.07 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  66.55 
 
 		 281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  64.77 
 
 		 281 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  66.9 
 
 		 281 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  61.67 
 
 		 287 aa  318  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  55.75 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  61.32 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  60.98 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  61.32 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  61.32 
 
 		 287 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  54.36 
 
 		 287 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  50.18 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  42.91 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  42.91 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  42.91 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  42.91 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  42.91 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  42.86 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  42.86 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  42.55 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  42.55 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  42.55 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  42.86 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  42.55 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  42.14 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  44.29 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  40.5 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  40.64 
 
 		 281 aa  188  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  39.43 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  39.29 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  37.32 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  38.95 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  37.81 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  38.95 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  38.95 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  38.43 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  38.21 
 
 		 286 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  37.5 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  35.97 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  36.82 
 
 		 280 aa  168  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  34.28 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.11 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.68 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  34.98 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  32.46 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.57 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.22 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.16 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.8 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.87 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  31.45 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  30.6 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  36.01 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.68 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.98 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.8 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  27.76 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  25.81 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  27.68 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  28.47 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  28.68 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  30.14 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  29.59 
 
 		 306 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  29.69 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  29.04 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  28.03 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  27.64 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  29.04 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  29.04 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  26.99 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.1 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.47 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.89 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  27.17 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  28.57 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  28.41 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  28.41 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.43 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  36.43 
 
 		 302 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.87 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  27.49 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  40.19 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  26.3 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  29.35 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  41.12 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  26.74 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  27.15 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  30.36 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  27.62 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  27.54 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>