More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5898 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  100 
 
 
282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  92.91 
 
 
282 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  92.91 
 
 
282 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  91.13 
 
 
282 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  94.68 
 
 
282 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  94.33 
 
 
282 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  93.97 
 
 
282 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  84.04 
 
 
918 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  84.75 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  84.75 
 
 
282 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  84.4 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  83.69 
 
 
282 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  68.33 
 
 
282 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  69.86 
 
 
282 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  68.68 
 
 
282 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  82.1 
 
 
229 aa  357  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  59.57 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  57.65 
 
 
310 aa  311  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  56.23 
 
 
280 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  53.38 
 
 
281 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  52.67 
 
 
281 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  47.87 
 
 
280 aa  222  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  42.47 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  41.95 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  43.48 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  41.04 
 
 
302 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  39.17 
 
 
314 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  40.72 
 
 
302 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  39.71 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  43.49 
 
 
312 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  40.93 
 
 
302 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  41.99 
 
 
302 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  40.57 
 
 
287 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  38.73 
 
 
289 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  38.73 
 
 
289 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  39.26 
 
 
341 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  40.62 
 
 
286 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  41.11 
 
 
324 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  42.61 
 
 
293 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  41.9 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  39.02 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  39.02 
 
 
305 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  40.42 
 
 
324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  40.83 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  38.61 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  39.72 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  38.33 
 
 
295 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  38.75 
 
 
334 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  39.53 
 
 
310 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  39.13 
 
 
318 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  38.11 
 
 
315 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  40.27 
 
 
290 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  39.16 
 
 
306 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.28 
 
 
290 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  40.42 
 
 
289 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  38.3 
 
 
286 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  39.5 
 
 
317 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  38.89 
 
 
306 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  39.16 
 
 
306 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  35.38 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  38.6 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  36.93 
 
 
290 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.59 
 
 
290 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  38.19 
 
 
290 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  37.32 
 
 
285 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  38.3 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  37.5 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  37.15 
 
 
290 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  38.3 
 
 
274 aa  169  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  39.51 
 
 
320 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  38.65 
 
 
326 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  37.67 
 
 
336 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  37.28 
 
 
289 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  39.22 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  37.63 
 
 
277 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  38.52 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  38.18 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  34.42 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  38.11 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  38.52 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  37.94 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  38.52 
 
 
304 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  37.76 
 
 
324 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  37.76 
 
 
329 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  36.71 
 
 
305 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  37.1 
 
 
303 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  39.79 
 
 
306 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  37.99 
 
 
286 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  37.54 
 
 
302 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  41.55 
 
 
285 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
287 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  38.46 
 
 
302 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  39.46 
 
 
285 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  37.68 
 
 
304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  39.02 
 
 
286 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  34.05 
 
 
287 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  38.87 
 
 
286 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  37.54 
 
 
300 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  34.88 
 
 
291 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  36.5 
 
 
271 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>