293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4343 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  45.16 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  41.79 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  39.58 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  38.08 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  35.71 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  39.02 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  36.07 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  38.46 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  36.04 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  38.19 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  35 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  37.14 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  37.46 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  34.29 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  33.93 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  33.93 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  33.93 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  33.93 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  33.93 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  35.82 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  37.14 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  36.04 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  36.04 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  38.57 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  35.34 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  35 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  34.88 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  36.82 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  34.86 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  34.86 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  34.86 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  36.79 
 
 		 281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  35.66 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  35.09 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  35.82 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  33.57 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  37.5 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  34.62 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  34.27 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.52 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.16 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  31.16 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.52 
 
 		 290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  30.96 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.96 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.67 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  29.71 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  30.5 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.45 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  28.72 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  27.34 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  28.57 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  30.6 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  27.96 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  28.78 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  28.11 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  26.13 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  28.83 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  26.13 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  26.69 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  29.63 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  26.06 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  27.46 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  26.62 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  26.26 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.4 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  25.8 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  24.2 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  25.33 
 
 		 302 aa  89  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  27.37 
 
 		 329 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  27.37 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  25.33 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  25.44 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  25.33 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  26.21 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  26.99 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  26.24 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  25.18 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  25.83 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  25.18 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  24.91 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  25.72 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  23.66 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  26.04 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  25.18 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  26.88 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  25 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  25.44 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  24.82 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  22.61 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  25.54 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>