More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3331 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  44.25 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  44.83 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  44.64 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  45.17 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  45.17 
 
 		 289 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  44.48 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  43.94 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  43.94 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  44.14 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  40.42 
 
 		 287 aa  242  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  44.48 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  43.3 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  44.64 
 
 		 290 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  40.07 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  41.81 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  40.93 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  41.52 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  36.59 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  37.94 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  38.03 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  37.06 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  39.44 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.64 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.64 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  35.23 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  35.19 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  37.37 
 
 		 326 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  37.24 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  35.54 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  35.13 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  35.19 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  33.45 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.86 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  34.27 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  34.84 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  33.81 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  34.54 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  35.22 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  34.04 
 
 		 320 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  34.86 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  34.49 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  32.64 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  34.04 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  34.88 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  32.53 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.97 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  33.79 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  34.15 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  34.42 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  35.38 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  32.53 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.42 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  33.45 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.42 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  34.4 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  34.4 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  34.4 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  34.4 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  34.4 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  34.15 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  33.45 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  31.54 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.98 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  33.7 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  34.04 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  34.04 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  32.12 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  31.36 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  34.04 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  34.04 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  31.14 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.71 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  33.81 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  31.6 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  33.81 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  34.3 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  32.98 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  32.98 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  32.74 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  32.98 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  32.17 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  32.24 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  35.34 
 
 		 918 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  34.42 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  32.98 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  33.56 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  33 
 
 		 302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  34.18 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  32.98 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  30.66 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  34.42 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  32.62 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  34.3 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  33.1 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  35.03 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  30.92 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>