More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1527 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  66.55 
 
 		 279 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  68.33 
 
 		 281 aa  361  8e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  63.19 
 
 		 287 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  62.85 
 
 		 287 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  62.5 
 
 		 287 aa  347  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  62.5 
 
 		 287 aa  347  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1797  thioredoxin domain-containing protein  68.68 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00348973  hitchhiker  0.000000176932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  59.58 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  62.72 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  58.54 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  62.85 
 
 		 287 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2662  thioredoxin domain-containing protein  62.85 
 
 		 287 aa  314  9e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00566405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  62.85 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  62.85 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1314  putative thioredoxin-like protein  49.46 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0231071  normal  0.110772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  45.39 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  45.39 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  45.39 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  45.39 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  45.39 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  45.39 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  45.39 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  45.39 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  45.39 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  45.39 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  44.68 
 
 		 293 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  44.68 
 
 		 293 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  44.68 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  44.68 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  44.68 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  44.13 
 
 		 289 aa  215  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  43.06 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01318  hypothetical protein  41.61 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  40.71 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  41.55 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  39.64 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  40 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  40 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  40 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0272  thioredoxin domain-containing protein  40.99 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0149418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0498  hypothetical protein  39.36 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  38.16 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4343  thioredoxin domain-containing protein  38.57 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0804  thioredoxin  38.3 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  37.81 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  33.96 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.91 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  32.51 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  31.1 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.99 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.58 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  30.88 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.93 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.87 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.53 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  33.45 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.88 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.88 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.65 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  28.11 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.67 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  30.55 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  29.78 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.33 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28.94 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  26.69 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  30 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  28.99 
 
 		 303 aa  95.5  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  27.56 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.4 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  30.55 
 
 		 918 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  27.3 
 
 		 306 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  27.7 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  28.52 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.9 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  28.21 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  29.37 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  30.4 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  29 
 
 		 282 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  29.37 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  30.4 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  30.4 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  27.43 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  27.24 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  27.43 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.56 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  35.12 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  35.12 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  30.4 
 
 		 326 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  25.83 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  27.82 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  31.37 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  26.86 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  28.23 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.27 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  26.95 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  40.19 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>