More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1063 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  100 
 
 		 918 aa  1742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  99.34 
 
 		 301 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  99.29 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  99.29 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  96.45 
 
 		 282 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  85.11 
 
 		 282 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  84.75 
 
 		 282 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  84.04 
 
 		 282 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  86.52 
 
 		 282 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  84.4 
 
 		 282 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  99.13 
 
 		 229 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  84.04 
 
 		 282 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  83.69 
 
 		 282 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  71.89 
 
 		 282 aa  406  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  73.05 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  72.95 
 
 		 282 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  60.28 
 
 		 280 aa  314  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  58.01 
 
 		 310 aa  308  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  56.01 
 
 		 280 aa  295  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  53.38 
 
 		 281 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  52.78 
 
 		 281 aa  283  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  46.3 
 
 		 302 aa  224  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  45.18 
 
 		 302 aa  223  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  48.78 
 
 		 280 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  43.19 
 
 		 302 aa  218  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  42.86 
 
 		 302 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  43.33 
 
 		 326 aa  213  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  42.14 
 
 		 314 aa  201  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  40.57 
 
 		 341 aa  200  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  41.39 
 
 		 295 aa  196  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  40.96 
 
 		 286 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  38.56 
 
 		 306 aa  191  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  39.15 
 
 		 287 aa  185  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  42.01 
 
 		 312 aa  185  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  38.03 
 
 		 289 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  38.03 
 
 		 289 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  41.2 
 
 		 302 aa  180  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  38.77 
 
 		 318 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  40.56 
 
 		 289 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  42.96 
 
 		 293 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  41.49 
 
 		 287 aa  173  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  37.84 
 
 		 305 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  39.52 
 
 		 302 aa  172  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  40.91 
 
 		 289 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  35.47 
 
 		 330 aa  171  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  38.97 
 
 		 290 aa  171  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.54 
 
 		 290 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  41.79 
 
 		 293 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  35.17 
 
 		 289 aa  168  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  39.93 
 
 		 324 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  39.86 
 
 		 274 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  38.81 
 
 		 317 aa  165  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  38.68 
 
 		 324 aa  164  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.62 
 
 		 290 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  38.67 
 
 		 310 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  37.32 
 
 		 285 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  39.1 
 
 		 306 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  34.42 
 
 		 287 aa  161  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  37.19 
 
 		 306 aa  161  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.49 
 
 		 290 aa  161  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36.91 
 
 		 290 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  37.11 
 
 		 315 aa  160  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  38.08 
 
 		 290 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  39.27 
 
 		 286 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  38.65 
 
 		 290 aa  159  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  37.85 
 
 		 306 aa  159  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  37.72 
 
 		 302 aa  157  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.92 
 
 		 277 aa  157  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  36.15 
 
 		 334 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  36.11 
 
 		 290 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  38.72 
 
 		 306 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  37 
 
 		 336 aa  154  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  38.87 
 
 		 326 aa  154  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  37.98 
 
 		 324 aa  153  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2497  thioredoxin  98.55 
 
 		 69 aa  152  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  40.56 
 
 		 285 aa  152  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  37.68 
 
 		 304 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  38.68 
 
 		 289 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  37.41 
 
 		 304 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  37.28 
 
 		 329 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  37.54 
 
 		 320 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  40.34 
 
 		 306 aa  148  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  36.14 
 
 		 303 aa  147  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  31.21 
 
 		 285 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  38.79 
 
 		 286 aa  147  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  40.29 
 
 		 307 aa  147  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  38.63 
 
 		 312 aa  146  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  35.84 
 
 		 311 aa  145  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  36.62 
 
 		 304 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  60 
 
 		 285 aa  144  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  36.93 
 
 		 286 aa  144  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.77 
 
 		 282 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  38.97 
 
 		 311 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  32.51 
 
 		 287 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  37.94 
 
 		 286 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  36.97 
 
 		 304 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  43.23 
 
 		 337 aa  141  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  34.93 
 
 		 286 aa  140  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  46.75 
 
 		 235 aa  140  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  33.94 
 
 		 287 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>