More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2496 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  99.13 
 
 		 918 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  99.56 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  99.13 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  99.13 
 
 		 282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  83.84 
 
 		 282 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  83.41 
 
 		 282 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  96.07 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  82.1 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  85.59 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  83.41 
 
 		 282 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  82.97 
 
 		 282 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  82.53 
 
 		 282 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  69.3 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  70.31 
 
 		 282 aa  296  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  70.18 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  58.52 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  54.39 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  53.45 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  50.44 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  49.56 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  46.93 
 
 		 280 aa  155  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  39.68 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  39.52 
 
 		 302 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.65 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  37.35 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  37.25 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.65 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.65 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  34.94 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  37.61 
 
 		 314 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  38.03 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.53 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  34.71 
 
 		 306 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  37.5 
 
 		 289 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  36.64 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  34.55 
 
 		 341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  37.93 
 
 		 289 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  37.21 
 
 		 312 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  38.16 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  34.35 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  39.22 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  37.13 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  33.19 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  35.06 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  35.47 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  34.73 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  38.26 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.48 
 
 		 290 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  33.62 
 
 		 305 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.76 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  33.04 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.19 
 
 		 290 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  34.78 
 
 		 317 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  33.6 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  33.47 
 
 		 310 aa  104  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  34.36 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  34.36 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  34.36 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  34.36 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.91 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  32.48 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  34.36 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  34.36 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  34.36 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  34.36 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  34.36 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.63 
 
 		 330 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  32.16 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.05 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  32.77 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  33.9 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.64 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  31.25 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  32.05 
 
 		 306 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  32.77 
 
 		 324 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  31.76 
 
 		 306 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  35.62 
 
 		 289 aa  98.6  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  31.9 
 
 		 302 aa  98.2  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  33.04 
 
 		 293 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  33.04 
 
 		 293 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.05 
 
 		 306 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.63 
 
 		 306 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  32.35 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  30.4 
 
 		 286 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  32.6 
 
 		 294 aa  95.9  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  32.6 
 
 		 293 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  32.6 
 
 		 293 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  31.93 
 
 		 334 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  32.6 
 
 		 293 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  30.7 
 
 		 287 aa  94.7  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.33 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  31.47 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.62 
 
 		 324 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  31.47 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  35.93 
 
 		 307 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  31.47 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  31.62 
 
 		 305 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  32.19 
 
 		 320 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>